Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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RABGEF1Q9UJ41 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1Q9UJ41 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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