Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEFF2Q9UIK5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms