Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA9Q9UGM1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms