Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IFT172Q9UG01 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFT172Q9UG01 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms