Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CGGBP1Q9UFW8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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