Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP35Q9P2H5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
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