Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VAPAQ9P0L0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VAPAQ9P0L0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms