Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GDE1Q9NZC3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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