Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GDAP2Q9NXN4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GDAP2Q9NXN4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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