Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DNAJC28Q9NX36 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJC28Q9NX36 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms