Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HPF1Q9NWY4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPF1Q9NWY4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms