Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASF1BQ9NVP2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms