Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FBXO28Q9NVF7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FBXO28Q9NVF7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms