Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKDREJQ9NTG1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms