Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC4BQ9NT99 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms