Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNTG1Q9NSN8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms