Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNX15Q9NRS6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms