Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLE3Q9NRF9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms