Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FANCFQ9NPI8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
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