Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FZD3Q9NPG1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms