Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
A4GALTQ9NPC4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms