Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMYD3Q9H7B4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMYD3Q9H7B4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms