Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 LINC01697-206ENST00000616647 544 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC091901.1-201ENST00000517722 736 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 PFDN1-201ENST00000261813 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SMIM30-201ENST00000397764 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC098679.3-203ENST00000514881 919 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC026254.4-201ENST00000581118 454 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms