Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR12Q9C0I1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms