Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5DQ9BY66 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms