Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SCAPERQ9BY12 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAPERQ9BY12 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms