Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SNHG12Q9BXW3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SNHG12Q9BXW3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms