Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CARD11Q9BXL7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms