Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BBS2Q9BXC9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms