Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRIP1Q9BX63 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms