Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KATNB1Q9BVA0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms