Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM79Q9BSE2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM79Q9BSE2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms