Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREX2Q9BQ50 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms