Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GFI1Q99684 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GFI1Q99684 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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GFI1Q99684 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GFI1Q99684 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GFI1Q99684 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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GFI1Q99684 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFI1Q99684 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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