Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCNX1Q96RV3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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