Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A9Q96Q91 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms