Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms