Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRAPPC9Q96Q05 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms