Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms