Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms