Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SENP8Q96LD8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SENP8Q96LD8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms