Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EP400Q96L91 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms