Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LCORQ96JN0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LCORQ96JN0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LCORQ96JN0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LCORQ96JN0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LCORQ96JN0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LCORQ96JN0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms