Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CELF6Q96J87 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms