Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TPD52L3Q96J77 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms