Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
BORCS6Q96GS4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BORCS6Q96GS4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms