Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms