Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms