Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCE1Q969G3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms