Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB13Q92826 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB13Q92826 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms